如果用户发现自己的号码被恶意标记，可以尝试以下步骤将恶意标记清除：

1、联系标记者：如果标记是由个人进行的，例如误认为用户的电话是骚扰电话或诈骗电话，可以尝试联系标记者，解释清楚情况并请求对方取消标记。

2、寻求主要运营商的帮助：用户可以联系主要运营商的客服，如中国移动、中国联通、中国电信等，请求取消标记。客服会要求用户提供相关证明材料，并进行审核，审核通过后会取消号码标记。

3、提交申请：使用号码标记取消平台，提交申请，并提供相关证据证明该号码未涉及骚扰电话、诈骗电话等违法活动。需要注意的是，平台只能处理用户提交的合理、真实、有效的申请。用户需要向平台提供有关证据和说明，证明自己未从事骚扰电话、诈骗电话等违法活动，否则申请很可能会遭到拒绝。在提交申请时，用户需要仔细阅读平台的操作规范和注意事项，确保提交的申请符合平台的官方要求。此外，为了避免成为恶意标记的对象，用户也可以加强自身的信息保护意识，不随意泄露个人的电话号码和隐私信息，减少骚扰电话的频率。